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新聞資訊

蛋白質圖譜盲點清單

2018-03-07
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後基因組時代,蛋白質序列有了,《Nucleic Acids Research》文章論述蛋白質的實際功能遠非序列所能描述。


每個生物體有擁有一張構建自我生存所需蛋白質的藍圖。多虧了蛋白質圖譜計劃,人們現在已經知道了大多數蛋白質在這些藍圖上的定位。遺憾的是,我們仍然不清除大多數蛋白質在體內的實際作用。

盧森堡大學係統生物醫學研究中心的實驗和計算科學家跨學科研究團隊在《Nucleic Acids Research》發表文章,係統性地定量和定性了這之間存在的差異究竟有多大,並列出了酵母和人類細胞中有待探索的蛋白酶清單。

通過這項研究,科學家們前所未有地預測了在未知功能的蛋白質中有多少是酶,它們是活細胞用來處理每秒鍾數以千計的化學反應的工具。“我們發現酵母和人體中約30%的‘未知’蛋白都是曾經被我們忽略的酶類,”“酶學和代謝學”研究項目的帶頭人Carole Linster博士說。

因為許多疾病,特別是遺傳代謝性疾病都跟基因缺陷導致的蛋白質錯誤折疊或不生產某些酶有關,研究人員希望通過分析基因序列和這些酶類圖譜找到解決疾病發病和發展的觸發因素。“我們已經破譯了成千上萬個來自不同物種的基因組,也知道它們翻譯成什麽蛋白質,”Linster說。但是從我們的分析中可以看出,機體生產的所有蛋白質中,大約有三分之一我們都無法確定它們在生物體內的真實功能。在蛋白質圖譜上,它們就像大量的沒被點亮的盲點。“

當考古學家找到了一份來自遠古的筆跡,他可能認識文中所有單獨的字母,但這並不代表他可以理解整篇文章,在理解全文之前,他先要弄清楚單詞的含義。“生物學家們調查罕見遺傳疾病的病因與此情況非常相似,想知道基因缺陷如何影響機體,僅僅知道它們的基因序列發生了哪些改變是不夠的。”

接下來,Linster博士和他的同事們準備更詳細地了解這些不為人知的蛋白質的功能,以解開生命蛋白質奧秘的全部謎題。
部分代謝酶鑒定實驗和計算策略
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