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新聞資訊

原位雜交技術——上海hjc黄金城生物醫藥股份有限公司

2015-07-21
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原位雜交(insituhybridization)用特定標記的已知堿基序列核酸作為探針與組織、細胞中待檢測核酸按堿基互補配對的原則在原位進行特異性結合,形成雜交體,然後用與標記物相應的監測係統,通過免疫組織化學方法在被檢測核酸原位進行細胞內核酸定位。原位雜交可根據檢測物而分為細胞內和組織切片原位雜交;根據其用探針及檢測核酸的不同可分為DNA-DNA、RNA-DNA、RNA-RNA雜交。根據標記方法不同可分為放射性探針和非放射性探針。

其基本方法包括:固定、切片、雜交、顯色等主要步驟。


(一)取材與標本固定
1. 取材 對於原位雜交所用的材料要盡可能新鮮,為了防止RNA的降解,取材要迅速,取材後要盡快固定或冷凍保存。
2.固定 進行原位雜交的組織或細胞必須經過固定處理,固定的目的是為了①保持細胞形態原有結構;②最大限度保存細胞內的DNA或RNA的水平;③使探針易於進入細胞或組織內。
3.固定液 常用固定液有10%甲醛、4%多聚甲醛、冰醋酸-酒精混合液、Bouin氏固定液等。這些固定液都有不同的優缺點因此要根據具體的實驗對象,選擇最佳的固定液。
4.固定方法 組織標本取材後,迅速放入固定液中2~4h,取材組織大小為1cm×1cm×0.5cm,不宜太大。必要時,動物組織可進行灌流固定,然後將組織按要求取材放入20%蔗糖中,4℃過夜,次日可行冰凍切片。

(二)切片及細胞標本的製備
1.載玻片的處理 因為原位雜交一般在載玻片上進行,所以載玻片必須保持清潔且不能有任何核酸酶的汙染。一般載玻片可先經洗衣粉浸泡過夜,用流水衝洗、酸中浸泡4~8h,再用流水衝洗,雙蒸水洗2~3次。在160℃烤箱中烘烤2~4h。亦可經15磅高壓滅菌20min處理,可將載玻片上的核酸酶消除。
2. 組織切片與預處理
(1)冰凍切片:新鮮組織也可在取材後,直接置入液氮中迅速驟冷,冷凍切片後,4%多聚甲醛固定5~10min,也可保存在-70℃中待用。雜交前切片迅速恢複至室溫並幹燥,0.1mol PBS洗三次,2×SSC洗10min,滴加預雜交液室溫孵育1h。
(2)石蠟切片:組織固定後,常規石蠟包埋切片,可長期保存,隨時用於原位雜交。雜交前切片經①二甲苯脫蠟2次,每次10min;②純酒精洗2次,每次5min;③空氣幹燥5min;④梯度酒精複洗95%,80%,70%各1min;⑤0.1 mol PBS洗3次,每次5min;⑥2×SSC洗10min;⑦滴加預雜交液於濕盒內室溫孵育1h。
(3)培養細胞:每張載玻片滴加200μl濃度為1×105/m1的細胞懸浮液,空氣幹燥1~2min製成細胞塗片,也可直接用培養細胞蓋片。上述細胞片經酒精或多聚甲醛固定5min,其餘步驟同冰凍切片。

(三)試劑配製
配製溶液過程中均需戴手套,液體配製均用超淨水,所用瓶子均經160℃烘烤4h,主要目的是去除RNA酶。
1. DEPC水 將DEPC按1‰濃度加入超淨水中,充分混合後靜置過夜,15~20min高壓消毒,之後室溫避塵存放。
2. 0.1mol PBS pH 7.4
A液:0.1mol NaH2PO4為NaH2PO4 (MW:156.01,2H2O) 1.56g;DEPC水 100.00m1。
B液:0.1mol Na2HP04為Na2HPO4 (MW:358.14,12H2O) 17.907g;DEPC水 500.00m1。
A液:B液=9.5∶40.5 加NaCl使其濃度達0.85%。
3. 20×SSC 為NaCl(3mol/L) 8.765g;Na3C6H50H2O7·2(0.3mol/L) 4.410g;DEPC水50.00m1。
4. 4%多聚甲醛(pH 7.4) 為多聚甲醛4g;0.1mol PBS 100m1。
5. 緩衝液
(1) 緩衝液Ⅰ(pH 7.5) 為1mol Tris-HCl 100ml;5mol NaCl 20ml;消毒超淨水加至1000ml。
(2) 緩衝液Ⅱ(pH 9.5) 為1mol Tris-HCl 100ml;5mol NaCl 20ml;1molMgCI 50ml;消毒超淨水加至1000ml。
(3) 緩衝液 Ⅲ(pH 9.5) 為1mol Tris-HCl 100ml;1molEDTA 5ml;5mol NaCl 20ml;1molMgCI 50ml;消毒超淨水加至1000ml。
6. 去離子甲酰胺 將陰陽離子交換樹脂各5g加入50ml甲酰胺中,待樹脂下沉後用上清液。
7. 50%硫酸葡聚糖 5g硫酸葡聚糖加10ml DEPC水,不斷攪動使之完全溶解。
8. 50×Denhardt's液 為1%Fico11type 400(聚蔗糖) 0.2g;1%PVP(聚乙烯砒硌烷酮)0.2g;1%BSA(牛血清白蛋白)0.2g;DEPC水 20.0ml。
9. 預雜交液 為去離子甲酰胺5.0m1;20×SSC 2.0m1;鮭魚精DNA (10mg/m1) ;0.5ml(沸水變性10min);酵母tRNA (10mg/m1) 0.25m1;50%硫酸葡聚糖 2.00m1;50×Denhardt?蒺s液 0.20ml。

(四)雜交與顯色
1.雜交 將已標記的探針加入預雜交液即成為雜交液(探針濃度為1μg/m1),切片經2×SSC短暫浸洗後,滴加雜交液,於濕盒內置37℃或42℃孵育過夜。然後依次經2×SSC室溫浸洗1h,l×SSC室溫浸洗lh,0.5×SSC 37℃浸洗30min,0.5×SSC室溫浸洗30min。注意滴加雜交液時切片勿幹燥。
2. 顯色 以下各步均在室溫下進行。
(1)緩衝液I洗1min。
(2)用含2%正常羊血清和0.3%TritonX-100的緩衝液I孵育切片30min。
(3)用含1%正常羊血清和0.3%TronX-100的緩衝液I稀釋羊抗Dig抗體。
(4)將抗體稀釋液滴加在切片上,封口膜覆蓋,濕盒內4℃孵育過夜。
(5)緩衝液I洗10min。
(6)緩衝液Ⅱ洗10min。
(7)加顯色液,封口膜覆蓋,避光室溫孵育2~20h,隨時鏡檢,當顯色滿意時入緩衝液Ⅲ終止顯色。
顯色液臨用前配,其配方為:①NBT 45μl;②X-Phospllate液 35μl;③左旋咪唑      2.4mg;④緩衝液Ⅱ 加至10ml。
(8)常規脫水、透明、封固。
結果:雜交陽性信號為紫藍色顆粒。

(五)原位雜交對照試驗 
同免疫組織化學染色對照一樣,為證明原位雜交實驗操作的準確性和實驗結果的特異性,需要設置一係列對照實驗,具體的各種對照實驗的設置及其意義請參考原位雜交專著,以下僅介紹幾種常用的對照實驗。
1.省去標記探針 在做原位雜交時,以PBS或預雜交液替代雜交液,結果應為陰性,這是一種簡便而有意義的陰性對照實驗。如省去標記探針仍出現陽性反應,這一定是假陽性。
2.自身對照 用同一組織切片或塗片上與靶序列無關的其他結構作對照。陽性與陰性結構同在一個視野中,相互印證,這本身就是對陽性反應的特異性對照。
3.陰性對照 用已知不存在相應靶序列的組織標本雜交,結果應為陰性。陰性對照可排除在雜交過程中由於非特異性雜交反應等因素造成的假陽性結果。
4.陽性對照 用已知含靶序列的組織切片與待檢標本同樣處理,結果應為陽性,稱陽性對照。通過陽性對照可證明雜交過程中各個步驟以及所使用的試劑都合乎標準,實驗方法可靠。尤其當待檢標本為陰性時,陽性對照片呈陽性反應可排除待檢標本假陰性的可能。故若預期雜交結果為陰性時,就必須設陽性對照,當陽性對照亦不顯色,就證明雜交過程的某一步驟或所用試劑問題。
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